ISOGEN, ISOGEN-LS使用例


1. 収量の目安

<RNA>

 
試料 収量
tissue
mouse
liver
spleen
kidney
skeletal
brain
placenta
  6〜10µg RNA/mg tissue
  6〜10µg RNA/mg tissue
  3〜4µg RNA/mg tissue
  1〜1.5µg RNA/mg tissue
  1〜1.5µg RNA/mg tissue
  1〜4µg RNA/mg tissue
ラットまたは下垂体または
ヒト肝針生検材料
  4〜8µg RNA/mg tissue
plant
ArabidopsisまたはTobacco
  150〜200µg RNA/0.5〜1g weight tissue
culture cells
epithelial
fibroblasts
  8〜15µg RNA/106 cell
  5〜7µg RNA/106 cell
blood
(ヒトまたは動物)
  7〜15µg RNA/ml blood
     

<DNA>

 
試料 収量
tissue
liver
kidney
skeletal
brain
placenta
3〜4µg DNA/mg tissue
3〜4µg DNA/mg tissue
2〜3µg DNA/mg tissue
2〜3µg DNA/mg tissue
2〜3µg DNA/mg tissue

culture cells
(human, rat, mouse)

5〜7µg DNA/106 cells

 

2. ISOGEN法とチオシアン酸グアニジン-塩化セシウム(GT-CsCl)超遠心法の比較

 
ISOGEN法
GT-CsCl超遠心法
総RNAa
β-actin mRNAb
総RNAa
β-actin mRNAb
ヒト乳房上皮細胞
7.0±0.4
4.1±0.3
5.6±0.6
3.1±0.2
ラット乳房
4.7±0.2
6.7±0.6
3.4±0.4
5.0±0.4
マウス肝
7.4±0.4
5.7±0.3
4.8±0.4
3.9±0.4
  a. µg/mg組織あるいは106細胞

b. β-actin cDNAを用いたノーザン分析におけるデンシトメータ単位/mg組織あるいは106細胞

 

3. ISOGEN使用例

<ISOGEN法で単離した総RNAの電気泳動>

 
TotalRNAPhoto1
  • lane1-3 ラット胸腺RNA(3µg/lane)
  • lane4-6 ヒト乳房上皮細胞RNA(5µg/lane)
ホルムアルデヒド-(1%)アガロース電気泳動
臭化エチジウム染色
TotalRNAPhoto2
  • lane1 ラット胸腺RNA(3µg/lane)
  • lane2 ラット胸腺RNA(3µg/lane)
  • lane3 ラット胸腺RNA(3µg/lane) RNase処理(5µg/ml, 30min., 37°C)
  • lane4 ラット胸腺RNA(3µg/lane) DNase処理(50units, 30min., 37°C)
ホルムアルデヒド-(1%)アガロース電気泳動
臭化エチジウム染色
TptalRNAPhoto3
  • lane1 ラット胸腺RNA(3µg/lane)
  • lane2 ラット胸腺RNA(3µg/lane)
  • lane3 ラット胸腺RNA(3µg/lane) RNase処理(5µg/ml, 30min., 37°C)
  • lane4 ラット胸腺RNA(3µg/lane) DNase処理(50units, 30min., 37°C)
  • lane5 BPB
ホルムアルデヒド-(1%)アガロース電気泳動後ナイロンメンブレンにブロッティング
メチレンブルー染色
   

<ISOGEN法で単離したRNA、DNA及びタンパク質のNorthern、Southern、Westernブロッティング>

 
NorthernPhoto
  • A : 成長ホルモン(GH)cDNAを用いて、総RNA(5µg/lane)中のGHmRNA(1kb)をNorthern分析した。
  • B : GHcDNAを用いて、EcoRⅠで消化した総DNA(5µg/lane)中のGH遺伝子断片(11.4kb)をSouthern分析した。
  • C : 抗GH抗体を用いて、総タンパク質(50µg/lane)中のGH(22kDa)をWestern分析した。
   

<ISOGEN法で抽出した総RNAを用いたmRNAフィンガープリンティング>

 

ここをクリックして下さい。[mRNA Fingerprinting Kit Ver.1.0SG 使用例]

 

4. ISOGEN-LS使用例

<ISOGEN法で単離したhepatitis C viral (HCV) RNAを用いたRT-PCR>
  A : ヒト血清から単離されたHCV RNAを用いてnested PCR法により得られたHCVに特異的なPCR産物。
臭化エチジウムにより染色されたゲル上に256bpのHCVに特異的なPCR産物が認められる。
RR-PCR1
  • lane 1 RNAなし
  • lane 2 RCR産物(GR93-74)
  • lane 3 HCVネガティブコントロール
  • lane 4 RCR産物(GR93-72)
  • lane 5 HCVポジティブコントロール
左 : ヒト血清0.15mlから抽出されたRNA
右 : ヒト血清0.3mlから抽出されたRNA
     
  B : ヒト血清及び肝臓から単離されたHCV RNAを用いてRT-PCR法により得られたHCVに特異的なPCR産物。
臭化エチジウムにより染色されたゲル上に272bpのHCVに特異的なPCR産物が認められる。
RT-PCR
  • lane 1 RNAなし
  • lane 2 HCVネガティブコントロール(ヒト血清)
  • lane 3 HCVポジティブコントロール(ヒト血清)
  • lane 4 RCR産物(GR93-84)(ヒト血清)
  • lane 5 RCR産物(GR93-82)(ヒト肝臓バイオプシー)
  • lane 6 RCR産物(GR93-76)(ヒト血清)
  • lane 7 HCVネガティブコントロール(ヒト血清)

[Code No./容量] [特長] [保存条件] [使用上の注意] [参考文献] [製品添付マニュアル] [ISOGEN法の原理] [プロトコール, トラブルシューティング] [使用例]


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